Drejtori i Radio Marisë krijon programet,  përpunon planin vjetor dhe skemat programore, zgjedh bashkëpunëtorët dhe drejtuesit dhe përgjigjet për punën e gjithmbarshme të radios.

Roli dhe mënyra e zgjedhjes e drejtorit te Radio Marisë përcaktohet në nenin 24 të statutit të Shoqatës Radio Maria:
-Këshilli Drejtues mund të emërojë një Drejtor të përgjithshëm, nëse kjo është e dobishme për mbarëvajtjen e aktivitetit.
-Detyra e Drejtorit të Përgjithshëm mund t’i besohet edhe një personi që nuk bën pjesë në Shoqatë. -Kompetencat e Drejtorit të Përgjithshëm përcaktohen në aktin e emërimit.

Drejtori i Radio Marisë Shqiptare është: Dr. Don Prenkë Lazraj.